La Sociedad Chilena de Historia de la Medicina fue fundada en el año 1955, por el destacado médico e historiador Enrique Laval Manrique, quien encabezó una generación de profesionales y académicos de la salud que demostró una constante inquietud por la investigación y difusión del desarrollo de la medicina nacional. Su principal medio de publicación fue Anales Chilenos de Historia de la Medicina, constituida en 1959,  revista que reunió una serie de trabajos de estudios originales sobre algunos hitos relevantes de la salud pública nacional, biografías, especialidades, medicina nativa, entre otros aspectos.

La labor de la institución se prolongó hasta el año 1974 en virtud de las difíciles circunstancias sociales y políticas que atravesó  el país en aquella década. No obstante, en el año 2005, un grupo de médicos que compartió el mismo afán por el conocimiento histórico de la medicina que enseñaron los fundadores de la Sociedad, decidió restaurar la institución para instalar en el ámbito nacional una instancia de difusión y discusión de las nuevas perspectivas que ofrecía la historiografía médica en el siglo XXI. Un hito destacado ha sido la realización anual de la Jornada de Historia de la Medicina que, desde el año 2005, permanentemente ha congregado a especialistas de la historia de la medicina y de la salud a departir sus perspectivas y opiniones.

Así, desde aquel entonces, con el activo respaldo de miembros de la Universidad de Chile, la P. Universidad Católica, la U. de Valparaíso, la Academia de Medicina, el Colegio Médico de Chile, entre otras entidades, hasta el día de hoy, la nueva etapa de vida de la Sociedad aspira a ser un punto de encuentro de profesionales de distintas disciplinas de la salud, las ciencias sociales y las humanidades, que compartan un interés por los múltiples temas que conforman la realidad de la salud en el presente siglo.